Correction : un champignon commensal renforce la virulence de Salmonella

Rectification essentielle

Dans une mise à jour publiée concernant l’article original intitulé « Author Correction: Commensal yeast promotes Salmonella Typhimurium virulence » (Nature, 24 avril 2026), les auteurs ont apporté plusieurs corrections visant à clarifier des erreurs de texte, de légendes et de représentation graphique. Par exemple, une phrase du premier paragraphe de la section « C. albicans enhances Salmonella virulence » a été modifiée pour corriger l’identification d’un groupe de souris. Points clés :

• Objet : clarification des données et des analyses présentées.
• Portée : corrections affectant texte, légendes de figures et graphiques étendus.
• Versions : modifications appliquées aux versions HTML et PDF de l’article.

Erreur de repérage des cages corrigée

Une erreur de repérage a été détectée dans le premier paragraphe de la section sur l’interaction entre la levure commensale et la virulence de Salmonella : l’expression « cage 3 » a été remplacée par « cage 1 » dans la description des fèces analysées. Exemple concret : là où le texte indiquait initialement « Faeces of mice from cage 3 », il faut désormais lire « Faeces of mice from cage 1 ». Impacts et recommandations :

• Interprétation : affects the grouping and traceability of samples — revoir toute lecture basée sur la numérotation initiale.
• Réplicabilité : vérification des données d’origine recommandée pour les laboratoires souhaitant reproduire l’expérience.
• Exemple : si un lecteur avait attribué une variation microbiologique à la mauvaise cage, il doit maintenant reclasser ces données sous cage 1.

Clarification des méthodes statistiques

Les légendes de la Fig. 5b et 5d indiquaient initialement des « deux-tailed unpaired Student’s t-tests » ; elles ont été corrigées pour préciser que des tests de Mann–Whitney U (non paramétriques) ont été utilisés. Exemple de raison pratique : le test de Mann–Whitney est préféré lorsque les distributions ne suivent pas une normalité ou lorsque les effectifs sont faibles. Points saillants :

• Avant : légendes mentionnant le test t de Student.
• Après : légendes précisant l’emploi du Mann–Whitney U.
• Conséquence : interprétation statistique adaptée aux distributions observées dans les jeux de données présentés.

Valeurs de p réévaluées

Les barres d’importance statistique dans la Fig. 5b ont été mises à jour : les valeurs initiales « P = 0.0202 » et « P = 0.0343 » sont désormais affichées comme « P = 0.0107 » et « P = 0.0274 ». Exemple d’impact : dans les deux cas, les valeurs restent inférieures au seuil usuel α = 0,05, mais la première valeur corrigée (0.0107) renforce la force statistique observée. Points à retenir :

• Changement : ajustement des P-values affichées sur la figure.
• Interprétation : toutes deux restent significatives à α = 0,05 ; la précision des chiffres améliore la transparence.
• Exemple : réévaluer les conclusions secondaires dépendantes de la magnitude exacte des P-values.

Données graphiques et légendes mises à jour

Dans l’Extended Data Fig. 1a, des points représentant les souris de la cage 1 avant infection manquaient : ces points ont été ajoutés et la légende de la figure a été modifiée pour indiquer que les données sont présentées en médiane avec intervalle (« median with range ») au lieu de « moyenne géométrique ± écart-type ». Exemple d’impact visuel et analytique : la médiane avec intervalle est plus informative pour des distributions asymétriques ou en présence de valeurs extrêmes. Éléments importants :

• Graphique : ajout des points manquants pour garantir la complétude des séries temporelles.
• Légende : changement de « geometric mean ± s.d. » à « median with range », ce qui modifie la lecture descriptive des données.
• Exemple pratique : un lecteur observant des outliers doit désormais interpréter la dispersion via l’intervalle de la médiane plutôt que via l’écart-type géométrique.

Versions corrigées et crédits auteurs

Toutes les modifications décrites ont été intégrées aux versions HTML et PDF de l’article. Les auteurs et affiliations restent indiqués dans la notice ; la correspondance est assurée par Judith Behnsen. Quelques éléments d’identification utiles :

• Titre : Author Correction: Commensal yeast promotes Salmonella Typhimurium virulence.
• Date de publication : 24 avril 2026 (version de l’enregistrement).
• Auteurs (exemples) : Kanchan Jaswal, Olivia A. Todd, William Santus, Brian M. Peters, Judith Behnsen.
• Licence : article en accès ouvert sous une licence de type Creative Commons (permettant partage et adaptation avec attribution).

Pour un usage scientifique ou pédagogique, il est recommandé de consulter la version corrigée afin d’utiliser les descriptions, statistiques et graphiques à jour.